Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms