Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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Chmp3Q9CQ10 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Chmp3Q9CQ10 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp3Q9CQ10 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Chmp3Q9CQ10 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Chmp3Q9CQ10 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Chmp3Q9CQ10 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Chmp3Q9CQ10 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Chmp3Q9CQ10 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Chmp3Q9CQ10 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Chmp3Q9CQ10 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Chmp3Q9CQ10 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Chmp3Q9CQ10 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Chmp3Q9CQ10 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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