Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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