Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gdpd3Q99LY2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms