Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms