Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smim11aQ99J19 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smim11aQ99J19 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smim11aQ99J19 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smim11aQ99J19 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smim11aQ99J19 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smim11aQ99J19 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smim11aQ99J19 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smim11aQ99J19 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Smim11aQ99J19 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Smim11aQ99J19 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Smim11aQ99J19 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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