Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms