Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms