Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms