Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klc3Q91W40 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms