Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms