Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OptnQ8K3K8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms