Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phc3Q8CHP6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phc3Q8CHP6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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