Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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