Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc178Q8CDV0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc178Q8CDV0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc178Q8CDV0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc178Q8CDV0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc178Q8CDV0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc178Q8CDV0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc178Q8CDV0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc178Q8CDV0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc178Q8CDV0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc178Q8CDV0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc178Q8CDV0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc178Q8CDV0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc178Q8CDV0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc178Q8CDV0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc178Q8CDV0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc178Q8CDV0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc178Q8CDV0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc178Q8CDV0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc178Q8CDV0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms