Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lrif1Q8CDD9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lrif1Q8CDD9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lrif1Q8CDD9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lrif1Q8CDD9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lrif1Q8CDD9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lrif1Q8CDD9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lrif1Q8CDD9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lrif1Q8CDD9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lrif1Q8CDD9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lrif1Q8CDD9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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Lrif1Q8CDD9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Lrif1Q8CDD9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Lrif1Q8CDD9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Lrif1Q8CDD9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Lrif1Q8CDD9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms