Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nhlrc3Q8CCH2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nhlrc3Q8CCH2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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