Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Atg4aQ8C9S8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Atg4aQ8C9S8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Atg4aQ8C9S8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Atg4aQ8C9S8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Atg4aQ8C9S8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Atg4aQ8C9S8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Atg4aQ8C9S8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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