Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ccdc113Q8C5T8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ccdc113Q8C5T8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ccdc113Q8C5T8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ccdc113Q8C5T8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ccdc113Q8C5T8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ccdc113Q8C5T8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ccdc113Q8C5T8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ccdc113Q8C5T8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ccdc113Q8C5T8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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