Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Trim35Q8C006 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Trim35Q8C006 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Pfn4-201ENSMUST00000020967 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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