Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ctdsp2Q8BX07 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ctdsp2Q8BX07 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ctdsp2Q8BX07 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ctdsp2Q8BX07 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ctdsp2Q8BX07 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ctdsp2Q8BX07 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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