Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c2Q8BL74 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms