Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tubgcp5Q8BKN5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tubgcp5Q8BKN5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tubgcp5Q8BKN5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tubgcp5Q8BKN5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tubgcp5Q8BKN5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tubgcp5Q8BKN5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tubgcp5Q8BKN5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tubgcp5Q8BKN5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tubgcp5Q8BKN5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tubgcp5Q8BKN5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubgcp5Q8BKN5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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