Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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