Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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