Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms