Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc6aQ78XR0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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