Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GypcQ78HU7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms