Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme8Q715T0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms