Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LcorQ6ZPI3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms