Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssx9Q6XAS3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms