Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms