Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sohlh1Q6IUP1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms