Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms