Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cntn4Q69Z26 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cntn4Q69Z26 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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