Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9aQ68FE2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms