Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Vsx2Q61412 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Vsx2Q61412 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Vsx2Q61412 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vsx2Q61412 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms