Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms