Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbbp7Q60973 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms