Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Grik1Q60934 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Grik1Q60934 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Grik1Q60934 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Grik1Q60934 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Grik1Q60934 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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