Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms