Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX79

Shroom1, Protein Shroom1, mousemouse

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Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom1Q5SX79 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Shroom1Q5SX79 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Shroom1Q5SX79 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Shroom1Q5SX79 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shroom1Q5SX79 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Shroom1Q5SX79 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Shroom1Q5SX79 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Shroom1Q5SX79 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Shroom1Q5SX79 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Shroom1Q5SX79 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shroom1Q5SX79 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shroom1Q5SX79 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shroom1Q5SX79 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shroom1Q5SX79 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shroom1Q5SX79 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shroom1Q5SX79 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shroom1Q5SX79 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shroom1Q5SX79 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shroom1Q5SX79 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shroom1Q5SX79 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shroom1Q5SX79 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shroom1Q5SX79 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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