Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms