Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf12Q5SPL2 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms