Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim58Q5NCC9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms