Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Fam208bQ5DTT3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Fam208bQ5DTT3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Fam208bQ5DTT3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Fam208bQ5DTT3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Fam208bQ5DTT3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Fam208bQ5DTT3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Fam208bQ5DTT3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Fam208bQ5DTT3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Fam208bQ5DTT3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Fam208bQ5DTT3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Fam208bQ5DTT3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Fam208bQ5DTT3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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