Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms