Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28bQ45KJ6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms