Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap2Q3V1H1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap2Q3V1H1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms