Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm44Q3V089 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms